Исторические данные о постройке церкви не сохранились. По форме её можно отнести к концу XVII века. В 1699 году к храму добавили придел во имя Сергия Радонежского и, возможно, притвор.
Согласно Синодику, придел возвёл Сергей Иванович Милославский, стольник и вице-адмирал. Существует предание, что на месте нынешней Покровской полосы стоял храм Покрова, от которого сохранился образ, помещённый в новый храм.
Церковь Николы — это сложная композиция из разновеликих и разновременных объёмов. Основной объём — клетская церковь в два света с пятигранным алтарём (вероятно, построенным позже самой церкви).
На одной оси с клетью пристроена двухэтажная трапезная. Верхний этаж — хоры, нижний отделён от основного объёма столбами. К западу примыкает притвор с двумя карманами. В одном из них находится лестница, ведущая на колокольню. Колокольня с притвором четырёхъярусная, восьмерик над четвериком. Сохранились следы первоначальной композиции. Под колокольней — тамбур, вероятно, поздний. С северной стороны расположен придел Сергия Радонежского с четырёхгранным алтарём, который ниже основного объёма.
Стены церкви выполнены из деревянного сруба, обшитого тёсом. Формы проёмов относятся к концу XIX века. Перекрытия плоские, полы деревянные.
Барабаны глухие: один над основным храмом восьмигранный, другой над приделом — шестигранный. Главы обшиты железом. Стены в интерьере выкрашены масляной краской. В 1971 году кровлю покрыли щепой, тогда же отремонтировали и перекрасили обшивку.
Иконостас церкви можно отнести к концу XVII века.
В конце XIX века храм отреставрировали: под четверик и придел подвели гранитные фундаменты, стены обшили тёсом, главы, ранее крытые лемехом, обшили железом. Кровля также стала железной.
Церковь продолжала действовать во время Великой Отечественной войны и в годы советской власти. С 1990 года при храме открылся дом милосердия для престарелых, инвалидов и бездомных под попечением монахинь и послушниц. В апреле 2010 года на территории церкви сгорели несколько хозяйственных построек, но храм остался цел. В ночь на 22 апреля 2015 года случился пожар, который полностью уничтожил храм. Частично удалось спасти находившиеся в нём иконы, включая храмовую икону святителя Николая Чудотворца XVIII века. Сейчас храм восстанавливают: идут работы по внутреннему благоустройству, изготавливают иконостас, пишут новые иконы.
Реставрационные работы не проводились. Церковь обмерена архитектором Н. С. Рахманиной в 1967 году.
Размеры храма: 28х13 м.
На данный момент владельцем объекта культурного наследия федерального значения «Церковь Николая Чудотворца (деревянная)», XVII век, является Псковская епархия.